Segunda generación
- Illumina MiSeq: capacidad máxima de longitud de secuencias 2x300bp, salida total hasta 15GigaBases. Ideal para amplicones cortos o para anaĺisis de re-secuenciación.
- Illumina NextSeq500: capacidad máxima de longitud de secuencias 2×150, salida total hasta 120GigaBases. Ideal para amplicones cortos o para anaĺisis de re-secuenciación.
- Illumina NextSeq2000 (novedad): capacidad máxima de longitud de secuencias 2×300, salida total hasta 360GigaBases. Ideal para análisis de (meta)genómicos y (meta)transcriptómicos, amplicones cortos o para análisis de resecuenciación.
Tercera generación
- Oxford Nanopore MinIon: capacidad máxima secuencias largas (hasta 100Kb), salida total hasta 30GigaBases. Ideal para análisis genómicos/metagenómicos donde la portabilidad o la velocidad en la obtención de los resultados es un factor importante.
- PacBio Sequel II (novedad): capacidad ~ 4,000,000 de secuencias HiFi con longitud de ~10Kb (Circular Consensus Sequences, CCS), y con calidad de ~ Q80. Ideal para genomas completos en búsqueda de factores de resistencia, virulencia o nuevas características genómicas o para amplicones largos como, por ejemplo, el gen ribosomal 16S, alcanzando una profundad de anotación taxonómica hasta el nivel de especies o de cepa.