Módulo 2 / Análisis de genomas en el laboratorio de Microbiología Clínica

Este curso se dirige a estudiantes graduados, profesionales y practicantes de la
biología, la investigación biomédica y ciencias de la salud y, muy especialmente, a
profesionales en el ámbito de la Microbiología Clínica.

Lengua: castellano

Precio del módulo: 350 euros

Lugar de realización: Biblioteca del edificio de Fisabio-Salud Pública. Av. Catalunya, 21. 46020 València.

Inscripción

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Profesorado

Programa del módulo

Lunes, 6 de julio: Introducción a las técnicas de secuenciación masiva y la epidemiología molecular

09:00h - 10:00h  Bienvenida e introducción a las aplicaciones de la HTS. Epidemiología molecular. FGC.

10:00h - 11:00h Introducción a las técnicas HTS: Aplicaciones, metodologías y criterios. LRR.

Descanso 

11:30h - 14:30h Sesión práctica: Introducción a las máquinas virtuales y la Bioinformática. ACO, CVM.

Martes, 7 de julio: Caracterización preliminar de aislados

09:00h - 11:00h. Ficheros de lecturas de HTS. Calidad, filtrado e identificación de genes. IC.

Descanso

11:30h - 14:30h Sesión práctica: Manejo de ficheros de lecturas. Calidad, filtrado y análisis. IC, ACO.

Miércoles, 8 de julio: Mapeo, análisis de variantes y comparación entre aislados

09:00h - 11:00h Mapeo: búsqueda de referencia y mapeo. CVM.

Descanso

11:30h - 14:30h Sesión práctica: Mapeo y variantes. Filtrado y alineamiento múltiple. CVM, ASS.

Jueves, 9 de julio: Caracterización detallada de aislados. Análisis de ensamblados mediante plataformas Web

09:00h - 11:00h Ensamblado, anotación y core genómico. Plataformas web de análisis. LSB.

Descanso

11:30h - 14:30h Sesión práctica: Ensamblado de lecturas, anotación, uso de herramientas Web. ASS, CFC.

Viernes, 10 de julio: Estudio de brotes mediante árboles filogenéticos

09:00h - 11:00h Fundamentos de reconstrucción filogenética. Estudio de brotes. FGC.

Descanso

11:30h - 14:30h Sesión práctica: Árboles filogenéticos. Interpretación en el estudio de brotes. CFC, CVM.