Contacto

 

 

Directora Summer School: 
M. Pilar Francino
 
Administrador Summer School:
Kevin Cifuentes
Telf.: 961 925 911

 

 
 

SUMMER SCHOOL - Module 1

 

 

 

 


Módulo 1/ Introducción a la secuenciación de genomas completos bacterianos y virales con tecnología Oxford nanopore e illumina - SOLO DISPONIBLE PARA MIEMBROS DE LA DGSP

Fechas: del 31 de mayo al 3 de junio

Coordinadora: Llúcia Martínez Priego (martinez_lucpri@gva.es)

Se propone un curso enfocado a la vigilancia genómica de patógenos. Para ello el curso explorará la preparación de librerías de genomas completos, tanto bacterianos como de virus, con dos tecnologías de secuenciación: la tecnología illumina para un trabajo de vigilancia más rutinario y la de Oxford Nanopore, mucho más rápida y enfocada principalmente a trabajos que requieran una respuesta en poco tiempo.

Las sesiones prácticas se completarán con sesiones teóricas (marcadas en rojo sobre el programa) sobre ambas tecnologías.
 

REGISTRATION - Solo disponible para miembros de la Dirección General de Salud Pública

Precio del módulo: 350 euros

Instructoras:

 

Llúcia Martínez Priego

Responsable del Servicio de Secuenciación de Fisabio

martinez_lucpri@gva.es

 

Griselda de Marco

Responsable de laboratorio

 


Loreto Ferrús

Técnico de laboratorio

Iris Manzano

Técnico de laboratorio




Programa:

Martes 31 mayo de 2022:

09:15 – 10:00 - Introducción a la preparación de librerías por secuenciación masiva
10:00 – 10:30 - Buenas prácticas en un laboratorio de secuenciación masiva
        
Pausa

11:00 – 12:00 - Cuantificación y normalización de ADN
12:00 – 13:00 - Fragmentación de genomas por illumina, limpieza e indexado
        
Comida

14:30 – 17:00 - Limpieza del indexado y normalización
       
Miércoles 1 de junio:

09:00 – 10:30 - Preparación de librerías de nanopore

Pausa

11:00 – 12:00 - Limpieza y cuantificación

12:00- 13:00 - Métodos de valoración de la calidad de las librerías

Comida

14:30 – 16:00 - Determinación de fragmentos por bioanalyser de ambas librerías

Jueves 2 de junio

09:15 – 10:30 - Introducción a la tecnología de Oxford Nanopore

Pausa

11:00 – 13:00 - Normalización y preparación de los pools para ambas librerías

Comida

14:30 – 15:30 - Creación de la Sample sheet para illumina
15.30-16:30 - Seguimiento de la calidad de un RUN por ambas tecnologías

Viernes 3 de junio

09:00 – 10:45 - Preparar y cargar el MiSeq

Pausa

11:00 – 12:00 - Cargar el MinIon
12:00-13.30 - Cierre del curso

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