Ficha Área
 
 
Ficha ampliada
Ficha breve

Personal de Investigación
 
Jefa del Área
Mª Pilar Francino
 

Investigadores

Andrés Moya Simarro
Amparo Latorre Castillo
Fernando González Candelas
F. Xavier López Labrador
Alejandro Mira Obrador
Giuseppe D'Auria
María José Gosalbes
Carles Úbeda Morant
Iñaki Comas Espadas
Alma Bracho Lapiedra

Investigadores Asociados Postdoctorales
 
Vicente Pérez Brocal
Victoria Furió Gomar González
Mariam Ferrer García
Arantxa López López

Técnicos de Investigación
 
Alejandro Artacho Pérez
Concepción Hueso Climent
Nuria Jiménez Hernández
Llúcia Martínez Priego
Manuela Torres Puente
Sandra García Esteban
M. Loreto Ferrús Abad
M. Dolores Catalán
Paula Corell
Xavier Pons Tamarit
David Pérez Villarroya
Luis Miguel Villamayor Cebolla
 
 

Historial del Grupo Investigación
 

 

Genómica y Salud
 
 

 

Objetivos

En el área de Genómica y Salud investigamos sobre microorganismos de interés para la salud humana, con la finalidad de proponer pautas de actuación a la administración sanitaria en relación a determinados patógenos, brotes epidémicos y enfermedades relacionadas con la alteración de las microbiotas simbióticas del cuerpo humano. Para este fin, desarrollamos y aplicamos nuevos métodos de análisis genómico, metagenómico, epidemiológico y evolutivo.
     

 

 

 


Lineas de Investigación

1. Genómica de microorganismos

Determinación y análisis de la secuencia genómica de los microorganismos.

Entre los objetivos prácticos de la secuenciación y análisis genómicos de microorganismos se pretende la identificación de los factores genéticos y metabólicos asociados a la patogenicidad, de los genes responsables de la virulencia o de la resistencia a tratamientos y de las propiedades antigénicas relevantes para la vacunación.

2. Metagenómica de comunidades microbianas

Secuenciación masiva de ADN y ARN aislado de muestras para obtener información de la composición y función de la comunidad.

Aunque el cultivo ha sido la herramienta tradicional de trabajo en microbiología, se estima que alrededor del 50% de los organismos residentes y patógenos del microbioma humano no son cultivables. Ello ha hecho necesario nuevas aproximaciones, que han sufrido una revolución en los últimos años con el desarrollo de la secuenciación masiva, las técnicas metagenómicas y la microfluídica, las cuales hemos desarrollado y perfeccionado en el Área de Genómica y Salud para estudiar el Microbioma Humano, es decir, el conjunto de microorganismos que conviven en el ser humano, desde el intestino a las vías respiratorias, la piel, la boca, la leche materna o el aparato urogenital.

3. Epidemiología molecular y evolución de microorganismos

Empleamos diversas técnicas de análisis genético y genómico para caracterizar microorganismos infecciosos obtenidos tanto de pacientes como de posibles fuentes de infección, ambientales o de otros organismos, para entender los procesos que llevan a la expansión de los microorganismos de interés en un grupo o población. Además de para caracterizar y entender la evolución de esos microorganismos, nuestro trabajo se aplica a:
• Estudio de brotes epidémicos y seguimiento epidemiológico de microorganismos.
• Determinación de rutas de transmission.
• Microbiología forense.
• Vigilancia epidemiológica molecular de patógenos y resistencias a antibióticos y antivirales.

4. Bioinformática y Bioestadística

Métodos bioinformáticos para el análisis genómico y análisis estadístico avanzado.
Los métodos desarrollados y aplicados en el Área se centran en:
• Control de calidad de los datos obtenidos de la secuenciación masiva.
• Análisis comparado de poblaciones bacterianas mediante estudios taxonómicos basados en el gen ribosomal 16S incluyendo análisis descriptivo y multivariante.
• Análisis comparado de genomas completos incluyendo distribuciones de polimorfismos con respecto a los genomas de referencia, agrupamiento de genomas en función de los perfiles de mutaciones o de los perfiles de genes compartidos, anotación funcional de los genomas, etc.
• Análisis de metagenomas/metatranscriptomas basados en la anotación funcional y distribuciones de las categorías génicas.
 


Grupos de investigación

- Laboratorio de Microbioma Oral
- Metagenómica del Microbioma Gastrointestinal
- Interacciones Patógeno-Microbiota
- Infección y Salud Pública
- Laboratorio de Virología
- Genómica de Tuberculosis

Unidades Mixtas de Investigación

- Unidad Mixta de Investigación en Genómica y Salud FISABIO-Salud Pública / Institut Cavanilles-Universitat de València
- Unidad Mixta de Investigación en Evolución y Salud FISABIO-Salud Pública / Institut Cavanilles-Universitat de València.